Контроллеры сайта на основе ZCMF находятся в папке application/modules/default/controllers

Все они наследуются от Zend_Controller_Action, поэтому нету никаких отличий от контроллеров в классическом сайте на Zend Framework

Для ознакомления с контроллерами Zend Framework прочитайте соответствующий раздел документации.